Ninja kaplumbağalar 2 vizyona girdi . Son maceralarında düşmanları Shredder’ı öldürdükten sonra birbirlerinden kopan Ninja Kaplumbağalar, hayatlarını kazanmak için ayrı ayrı yollara sapmışlardır. Leonardo, ustaları Splinter’ın isteği üzerine bir dünya turuna çıkmış, ancak bilinmeyen bir yerde inzivaya çekilerek geri dönmemiştir. Raphael gece olduğnda adi suçluların peşine düşen başına buyruk, maskeli bir kahramana dönüşmüştür. Michaelangelo partilerde çocukları eğlendirmeye başlamış, Donatello ise bir teknik destek hattında çalışmaya başlamıştır. Tüm bunlar olurken, usta Shredder New York’ta gerip olayların başgösterdiğini fark eder. Bir teknoloji şirketinin sahibi zengin iş adamı Max Winters, antik çağlardan kalmış bir orduyu tekrar hayata geçirip tüm dünyayı ele geçirmeyi hedeflemektedir. Üstelik, kaybettiği ustası Shredder’ın izinden giden Karai ve Foot Klan’ın da desteğini yanına almıştır. Ninja Kaplumbağalar; tekrar bir araya gelip kötülere karşı tek yumruk halinde savaşabilmesi için, eski dostları April ve Casey Jones’un da desteğine başvuracaktır.